Mittels Fernbedienungen können Z-Wave Netze sehr bequem konfiguriert und auch gesteuert werden. Fernbedienungen sind entweder exklusiv nur für Z-Wave entworfen oder als Universalfernbedienungen verfügbar, bei denen über Infrarot weitere Geräte im Audio/TV-Bereich steuerbar sind. Eine weitere Unterscheidung sind die Anzahl der steuerbaren Geräte bzw. Gerätegruppen oder der Szenen, die den einzelnen Bedienelementen der Fernbedienung zugeordnet werden.
Z-Wave-Fernbedienungen dienen häufig auch als portabler Z-Wave-Controller zum Anlernen von neuen Z-Wave-Geräten. Z-Wave spezifische Kommandos wie das Setzen und Löschen von Assoziationen oder das manuelle Konfigurieren von Z-Wave-Geräten ist eben so möglich.